本发明公开了一种憎水型渗透结晶防水剂及其制备方法，该憎水型渗透结晶防水剂由十二烷基苯磺酸、无水异丙醇、壬基酚过氧乙烯醚、氢氧化钠水溶液、次氯酸钠水溶液、硅酸钠水溶液、酒石酸、无水碳酸钠、丙烯酸钠与丙烯酸钙共聚合溶液、甲基硅醇钠溶液和去离子水11种原料制成。本发明不仅具有防水性能好、和具有抗裂、清洗、无收缩、自愈合、抗水压、表面憎水、防止水气渗入、防止霉斑生成等功能的优点，而且还具有施工简单、快捷、有无防水施工经验的人皆可迅速掌握防水施工技能、施工或使用时无毒、无公害等优点。