本发明公开一种异型孔加工装置，用于加工锥形钣金零件上的异型孔，包括电极机构和装夹机构，电极机构包括电极定位座，电极定位座上设有数个与异型孔相对应的电极定位孔，电极设置在电极定位孔中，电极定位座的中轴上设有连杆；装夹机构包括胎体和环形压板，胎体和环形压板上设有数个相匹配的螺孔，锥形钣金零件置于胎体和环形压板之间，并通过螺栓将胎体、锥形钣金零件和环形压板紧固连接，本发明还公开一种异型孔加工方法，采用前述装置对锥形钣金零件上的异型孔进行加工，操作方便，保证零件上各个异型孔的形状和位置精度要求，降低加工成本，提高生产效率。