本发明公开了一种基于光电效应的可补偿的供水管道生物膜在线监测装置。它包括发光系统、光纤、监测系统、光电效应系统、补偿电路系统、电路、显示器；两个发光系统与监测系统连接，监测系统与光电效应系统连接，光电效应系统与补偿电路系统连接，补偿电路系统再与电脑显示器连接；发光系统包括发光管和光耦合器，监测系统的发射接收合一探头、发射探头、接收探头，皆由固定装置固定在管壁上，光电效应系统包括两组顺次相连的光耦合器、CCD图像传感器、放大器，补偿电路系统包括两个A/D转换器分别与减法器连接。本发明适用于城市供水管道生物膜生长状况的连续在线监测，响应速度快，干扰少，环境因素造成的影响可补偿，稳定性好，准确率高。