本发明公开一种双极柔性直流输电系统的全站无功功率控制方法，同时刻至多一个换流单元处于交流电压控制模式，两个换流单元无功功率控制按容抗互锁原则控制，两个所述换流单元的无功分配策略为：(1)两个换流单元均处于双极功率控制模式时，两极输出无功功率与两极直流电压的绝对值成正比；(2)两个换流单元中一个单元处于双极功率控制，一个单元处于单极功率控制时，单极功率控制单元单独控制其输出无功功率，全站无功功率由双极功率控制单元来维持；(3)两个换流单元均处于单极功率控制时，两个换流单元单独控制各自输出无功功率。本发明方法实现了双极柔性直流输电系统两个换流单元的协调控制和优化运行。