本发明实施例公开了一种智能终端GOOSE端口独立性的检测系统及方法，用于对被测智能终端的GOOSE端口的独立性进行检测，所述检测系统包括：数字式继电保护测试仪、网络性能测试仪以及报文抓取设备；其中，网络性能测试仪向被测智能终端的第一GOOSE端口发送无效背景数据，数字式继电保护测试仪向被测智能终端的第二GOOSE端口发送有效GOOSE数据和控制命令，测试控制命令的执行时间，判断第一GOOSE端口的无效背景数据对第二GOOSE端口性能的影响；网络性能测试仪向被测智能终端的第一GOOSE端口发送有效背景数据，重启被测智能终端，根据在重启过程中所述报文抓取设备是否抓取到所述有效背景数据，判断第一GOOSE端口和第二GOOSE端口之间的独立性。