本发明公开了一种纤维束过滤器及其使用方法，过滤器包括容器以及设置在容器内的滤芯，容器中设有螺旋状的水流通道，且螺旋方向垂直于纤维束延伸方向，一进水管和一出水管均设于容器，且分别设置开口连通水流通道，进水管开口和出水管开口分别设于水流通道沿螺旋方向的两端，且至少具有一对等流量的分别位于进水管和出水管的开口高度差异设置。本发明过滤器，通过特别的螺旋状的水流通道的设计，使得过滤过程既有平行于纤维束方向的深层过滤，又有垂直于纤维束方向的深层过滤，使用可有效提高过滤精度，同时延长水与纤维束滤芯的接触时间，提高过滤效果。另外，进水管和出水管上等流量开口的高度差异设置也有利于保证过滤面积。