本申请提供一种电磁勘探数据采集和处理方法及系统。所述方法包括S1：在第一条测线上设置待测点A1、A2、…、AM；在第二条测线上设置待测点B1、B2、…、BN；S2：间隔选取第一条测线上以及第二条测线上的待测点为实际测点；S3：将所述实际测点按照A1、B2、A3、B4、…A(M-1)、BN的顺序依次首尾连接，形成链状测线；在链状测线上的每个实际测点布置数据采集装置，获取所述链状测线的第一电磁勘探数据；S4：按照S1-S3的步骤获取由其他相邻测线形成的链状测线上的第一电磁勘探数据；S5：基于第一电磁勘探数据计算所有测线上全部测点的第二电磁勘探数据。利用本申请中各个实施例，可以提高作业施工效率，节约成本，提高采集数据的分辨率。