本发明提供一种智能集群自组织控制仿真系统及方法，系统包括：演示场地、若干个位于所述演示场地的智能个体、布置于所述演示场地正上方的图像采集设备以及控制计算机；所述控制计算机分别与所述图像采集设备和各个所述智能个体通讯；每个所述智能个体的顶部均设置唯一的合作标识，基于所述合作标识，所述控制计算机对所述智能个体进行身份与位姿的识别。优点为：明显降低智能集群仿真系统中每个智能个体的设计难度，可灵活地实现多种自组织规则下的智能集群仿真，提高智能集群系统的适用性，降低成本。通过对合作标识的设计，明显提高了智能个体身份与位姿识别的速度与精确度；进而提高了仿真可信度。