本发明涉及一种船舶过坝排挡方法。该方法：首先，通过GIS软件及定位系统定位船舶航行位置；其次，设定预定航行区域，根据上述定位的船舶航行位置，判断其是否进入预定航行区域，若是，则执行下一步骤；否则，继续检测；再而，通知船舶驾驶员，并询问其是否需通过该预定航行区域内的水坝，若船舶驾驶员确认需通过预定航行区域内的水坝，则检测该船舶的吃水线，并执行下一步骤；否则，通知船舶驾驶员限时离开该预定航行区域；最后，根据该船舶编号及吃水线，安排船舶过坝线路，根据船舶驾驶员确认时间，安排过坝顺序，完成过坝排挡。本发明解决目前水坝通航枢纽船舶调度无法实时掌握上下游的预计来船情况，可以依据来船情况进行合理过坝排挡。