本发明提供了一种兽用中药组合物、其制备方法及用途，本发明中药组合物是由白头翁、椿皮的原生药粉或提取物为活性成分，加入药学上可接受的辅料或辅助性成分制备而成的制剂。药效学试验证明，将白头翁和椿皮配伍使用，在本发明的特定配比下，具有协同增效的作用，显著提升清热解毒、利尿散结、凉血止痢的治疗效果。与此同时，本发明提供的以中药提取物为原料药的药物组合物制备方法，使得工艺更加标准化、过程容易控制，以制备浓缩提取物的模式能够显著节省操作空间，且便于原料药的贮藏，技术优势明显。在优选技术方案中，通过少量添加苦楝皮和石榴皮，可以在一定程度上提升抗菌功效，从而使得本发明用于治疗畜禽肠道细菌性感染疗效更加突出。