本发明公开了一种基于草甘膦母液净化处理的水剂配制方法，所述的草甘膦母液来源于草甘膦制备过程中，双甘膦经氧化后结晶析出草甘膦原粉，固液分离后剩下草甘膦废水，再经过滤净化并由膜分离提浓后分离出草甘膦晶体而获得的草甘膦浓缩母液，所述的水剂配制方法包括通过调节PH和活性炭吸附等除杂手段对草甘膦浓缩母液进行纯化处理以满足草甘膦水剂的配制要求，并经加入草甘膦原粉和氨化处理后获得复合国家标准的草甘膦水剂。本发明实现了磷资源的进一步利用，制得的草甘膦水剂其甲醛含量远低于国家标准规定的要求，提高了草甘膦水剂的稳定性，在实现草甘膦母液循环利用的同时，更减小了环境的污染，具有良好的社会效益。