一种交互式透射电子显微镜虚拟仿真教学系统与方法，属于显微镜仿真教学系统与方法。包括有输入模块、控制模块、透射电子显微镜教学模块、典型样品经验数据库模块、数据处理分析模块、电源模块、音频输出模块和视频输出模块；在使用教学模式下，显示操作界面与透射电子显微镜三维模型，通过文字与语音提示操作步骤与注意事项，根据提示执行操作，显示三维模型相应运行结果，在用户操作完成时，给出操作评价；在典型样品经验数据库模式下，浏览典型样品测试的原始数据及分析结果，学习测试数据的分析方法及过程，积累经验；在数据处理分析模式下，人工输入样品测试的原始数据，将样品数据与典型样品经验数据库中的数据进行比对分析，输出分析结果。