本发明涉及烟草漂浮育苗领域，旨在提供一种提高烟草漂浮育苗种子发芽率和壮苗的方法。该方法是将用液体培养基培养的植物根内生真菌印度梨形孢的菌体和培养滤液与烟草育苗基质混匀，利用印度梨形孢的菌体及其释放在培养滤液中的物质提高烟草漂浮育苗的种子发芽率并促进烟苗生长和抗逆。本发明简便易行，用常规方法培养印度梨形孢，用标准规程混合基质、装盘、播种、漂浮育苗、炼苗和移栽，接种印度梨形孢的方式与漂浮育苗规程相配套。本发明能够使烟草种子发芽率提高；帮助烟苗根系耐受低氧胁迫，使烟苗根系发达、根干重增加；帮助根吸收营养，促进烟苗生长，使烟苗茎杆增粗、茎直径增加，使株高增加；使烟苗移栽后存活率提高。