本发明涉一种鸡笼清洗消毒系统，包括：冲洗单元、浸泡单元和灭菌单元，冲洗单元通过传送装置将鸡笼传送至浸泡单元，浸泡单元通过传送装置将鸡笼传送至灭菌单元，完成鸡笼的清洗与消毒；所述冲洗单元包括壳体，壳体上设置有电机，壳体内设置有纵梁，该纵梁具有凹槽，纵梁的两端分别设有驱动轮及从动轮，驱动轮和从动轮上安装有链条，链条的一部分位于凹槽内，链条上还设有卡勾，电机带动驱动轮转动，且壳体内壁上设有多个喷头。本方案所提供的消毒系统，能快速的完成鸡笼的冲洗、浸泡及高温灭菌。