本发明公开了一种制备纳米磷酸锆的方法，包括以下具体步骤：将质量比为2.5‑6.5∶7.0‑5.0∶5.0‑9.0:6.0‑7.5的离子液体、硝酸锆、磷酸水置于聚四氟乙烯高温反应釜中，在150‑180℃反应12～36h；反应结束后，冷却至室温，在产物中滴加10wt％的氢氧化钾调节pH至8～10，取固体产物用乙醇和水洗涤多次，并在100‑120℃真空干燥，得到白色的纳米多孔磷酸锆。此方法制备的纳米磷酸锆可作为性能优异的离子交换剂和吸附剂，并可广泛的运用到催化领域，具有较好的纳米结构特性。