本发明涉及高分子微球制备领域，特别涉及一种亲水性超大孔聚合物微球及其制备方法。采用自制的双亲性两嵌段大分子单体作为表面活性剂，通过悬浮聚合法制备微球，由于在吸水溶胀过程中亲水性链段会自发排列在面向水通道的微球的外表面，疏水性链段则通过双键参与聚合反应结合到微球骨架内部，从而一步实现了超大孔聚合物微球的制备和表面亲水改性。本发明制备的亲水性超大孔聚合物微球，微球骨架为交联聚苯乙烯，机械强度高，化学稳定性好，外表面为含糖聚合物或聚乙烯醇凝胶，亲水性好，且具有超大孔。该亲水性超大孔聚合物微球在酶固定化和蛋白质快速分离纯化领域有广泛的应用空间。