本发明公开了一种劣质原料生产润滑油基础油的加氢方法。劣质原料首先进行一段加氢精制反应，反应流出物进行分离；液体进入二段精制段进行深度脱氮和芳烃饱和反应，在二段中同时采用气液并流和逆流流程，精制生成油进行加氢裂化；裂化尾油进行异构脱蜡和补充精制反应，获得润滑油基础油馏分。本发明方法可在较缓和条件下对劣质原料中的含氮杂质进行加氢处理，使其满足加氢裂化进料要求，从而拓宽了润滑油基础油的原料来源；同时由于加氢精制温度大大降低，从而可以提高装置的运转周期，加工更劣质原料或者在同样运转周期下提高装置的加工能力。