本发明公开了一种核电厂弹棒事故不确定性分析方法，包括：(1)设置弹棒事故的输出参数；(2)设置多个输入参数并获取输入参数的期望值和不确定性；(3)针对输入参数和输出参数进行多次弹棒事故计算，并根据计算结果获取各输入参数对输出参数的敏感性因子；(4)根据输入参数的期望值、不确定性以及各敏感性因子计算输出参数在95％置信水平下95％概率的输出值。与现有技术相比，本发明对输入参数考虑不确定性，相比采用保守输入参数的方法输出参数更为真实；同时通过敏感性因子来表示各输入参数对输出参数的影响程度，并在敏感性因子的基础上统计计算输出值，使输出值更加合理、现实，不会加入过多的保守度，具有更大裕量。