本发明提供一种医用钻头清洗放置箱，包括箱体，所述箱体分为上下两层，通过设置在箱体中部的隔板隔开，所述隔板上开设有通槽，所述通槽中设置有钻头放置座，所述钻头放置座通过底部设置的升降气缸带动在箱体上层和下层之间移动，所述箱体下层灌装有清洗液，所述箱体下层两侧设置有超声波发射器，通过超声波清洗钻头。通过钻头放置座将钻头下降到清洗液中，并通过超声波对钻头进行清洗，并且加以辅助水流冲洗，提高钻头的清洗效率，避免使用加热的方式进行灭菌，防止钻头由于加热膨胀，减少使用寿命，并且通过升降气缸将清洗后的钻头送回箱体上层，避免人工拿取钻头造成清洗液被污染。