本发明公开了一种高速公路收费的支付方法、放行系统及支付系统，其支付方法包括：A、高速公路入口处的第一红外接收器接收移动终端发出驶入请求，将驶入请求和预存的入口信息发送给收费服务器，并控制道闸打开放行；B、高速公路出口处的第二红外接收器接收移动终端发出驶出请求，并将驶出请求和预存的出口信息发送给收费服务器；C、收费服务器根据入口信息、出口信息和驶出请求计算应缴费用并反馈给移动终端；D、第二红外接收器检测移动终端完成费用支付后，控制道闸打开放行。本发明采用红外发送方式，成本很低，通用性高，可适用于所有移动终端；且通讯距离合理，技术成熟及可实现性高，能减少车辆的等待时间。