本发明涉及有机化工领域。一种两步法绿色合成异硫氰酸酯的方法(1)将伯胺与苯氧基硫酰氯或取代苯氧基硫酰氯混合，然后加入水，反应0.5～12h，停止反应，冷却静置，抽滤，依次用10％盐酸、清水洗涤，即制得O‑芳基硫代酰胺中间体；(2)将O‑芳基硫代酰胺中间体溶于溶剂，反应时间为8～30h，停止反应，冷却，旋干，加入适量二氯甲烷使之溶解，干燥，浓缩，经柱层析分离(乙酸乙酯:石油醚＝1:5)，得到异硫氰酸酯。本发明以水作溶剂，在低温下合成中间体O‑芳基硫代酰胺，然后在有机溶剂中高温分解制备异硫氰酸酯，无需额外加入碱，且底物适用范围广泛、收率高，制备过程更加绿色环保。