本发明涉及核电技术领域，提供了一种百万千瓦级压水堆核电站中蒸汽发生器二次侧隔离方法，包括以下步骤：主蒸汽系统封堵步骤：将蒸汽发生器与主蒸汽系统之间的蒸汽出口限流器处封堵；给水系统封堵步骤：向主给水系统与蒸汽发生器的连接管道中注入水进行密封隔离；向辅助给水系统与蒸汽发生器的连接管道中注入水进行密封隔离；排污系统封堵步骤：将与蒸汽发生器连接的排污系统中的限流器处进行封堵；阀门关闭步骤：将与蒸汽发生器二次侧贯通的边界阀门全部关闭。本发明中，通过上述步骤，保证蒸汽发生器二次侧良好的气密性，实现蒸汽发生器二次侧完全隔离。