一种苹果霉心病多因子无损检测判别模型及其建立方法，模型公式为：Z＝1.585Y1+0.298Y2‑0.36Y3+0.270Y4，Y1、Y2、Y3、Y4分别表示可代表所有数据的三种主成分的数据，当Z＜0，说明苹果存在霉心病，其建立方法，选择样本数据后，选取数据，包括12个透射波长值和1个直径值、1个重量值，将数据进行归一化处理后进行主成分分析，选取累计贡献率超过90％的前四个主成分，进行Fisher判别分析，最终得到模型，本发明基于透射光谱，采用相关性分析进行变量选择能够有效的剔除冗余光谱信息，确定与苹果霉心病检测最相关的12个的光谱变量，降低了数据分析维数，其判别正确率可达92.73％，实现了对苹果霉心病的快速、无损、精准检测。