本发明公开了一种内燃动车组辅助交流系统，包括辅助发电机组、直投电路以及一路以上的逆变电路，所述辅助发电机组通过逆变电路为对应的内燃动车组的冷却风机和牵引通风机供电，所述辅助发电机组通过直投电路为对应的内燃动车组的直挂负载供电，还包括列车供电发电机组、第一开关组件和第二开关组件，所述列车供电发电机组通过第一开关组件分别为内燃动车组的空气压缩机、司机空调、蓄电单元以及直流负载供电，所述辅助发电机组通过第二开关组件分别为内燃动车组的空气压缩机、司机空调、蓄电单元和直流负载供电，所述第一开关组件与第二开关组件之间形成互锁。本发明具有结构简单、可靠性高等优点。