本发明公开了一种时序控制的多路流体采样系统及其方法。它包括前端进样手动针阀、前端进样气动针阀、样本保存组件、压力表、采样管路、吹扫口气动针阀、真空口气动针阀、缓冲罐和管路连接手动针阀、缓冲罐、手动针阀、干泵；缓冲罐上设有多路采样管路、手动针阀，每路采样管路上顺次连接有进样口针阀、进样口气动针阀、多个样本保存组件，压力表、吹扫口气动针阀、气动针阀、针阀，手动针阀与干泵相连，每个样本保存组件包括顺次相连的VCR接头、采样口气动针阀、钢瓶前端针阀、采样钢瓶、采样钢瓶尾端针阀。本发明的优势在于，具有多个采样通道，并且可以实现自动阀采样，解决了对流体在多个位置并且多个时间点高保真采集并保存样品的问题。