本发明公开一种高海拔地区薰衣草扦插育苗方法。该方法包括薰衣草母本植株壮枝养护、薰衣草的扦插、扦插后管理。在薰衣草母本植株壮枝养护中包括对薰衣草母本植株分别于2月初、7月下旬、10月下旬进行追肥，主要追施有机肥、钾肥、氮肥、过磷酸钙；雨季用混合杀菌剂灌根、定期除草等。扦插包括配制基质、蘸IBA溶液后扦插、扦插后用50％甲基托布津溶液为定根水。扦插后的管理用小拱棚内保温保湿，实时揭开或遮盖小拱棚，拆除小拱棚后，定期喷施叶面肥和杀菌剂。本发明方法各步骤均可精准操作，重复性高，有利于薰衣草扦插苗的工厂化、标准化生产。生根率达86～92％，生根后成活率达85％以上，扦插苗根系发达、径粗、叶多、生长健壮。