本发明公开了一种基于量子点荧光标记的便携式生化快速检测系统。包括荧光检测模块、光纤控制模块、自动进样模块、旋转检测台模块、电机控制模块和上位机模块，荧光检测模块、光纤控制模块、自动进样模块、旋转检测台模块和电机控制模块组成检测台装置，作为整个检测系统的硬件部分，电机控制模块分别与光纤控制模块、自动进样模块和旋转检测台模块相连，荧光检测模块与光纤控制模块连接，上位机模块分别与荧光检测模块和电机控制模块连接。本发明针对荧光标记方法定量检测生化样品的过程实现了自动化与高通量，测量精度高，检测速度快，所需样品少，体积较小便于携带。