本发明公开了一种含低浓度氟代芳烃废水的电化学氢化处理方法，所述的方法为：在含0.01～1mmol/L氟代芳烃的废水中，加入支持电解质得到电解阴极液；在以铑修饰的导电材料为阴极、以化学惰性导电材料为阳极的隔膜电解槽中进行电解反应，电解过程中电解阴极液pH控制为1～6，温度为0～50℃，电流密度为1～20mA/dm2；电解反应结束后，实现氟代芳烃中氟取代基和芳环的完全氢化；本发明所述反应可在常温常压和无有机溶剂的水体系中进行；废水中低浓度氟代芳烃污染物的氟取代基和芳环可完全氢化，这能极大提高废水的可生化性和降低废水的毒性；可高效率的处理低浓度(0.01～1mmol/L)氟代芳烃废水，实现氟代芳烃的完全转化，氟取代基和芳环完全氢化率大于95％，氟离子收率大于95％。