检测植烟土壤黑胫病菌定殖量的锁核苷酸增敏实时荧光定量PCR检测方法
摘要:
一种检测植烟土壤黑胫病菌定殖量的锁核苷酸增敏实时荧光定量PCR检测方法,该方法以烟草黑胫病菌中的5.8S ribosomal RNA及其相邻的ITS 区域片段设计引物;正向引物为:5’-TGAACGCATATTGCACTTCC-3’;反向引物: 5’-GACAAACCAGTCGCCAATTT-3’;LNA修饰位点以下划线表示。通过普通引物PCR扩增、克隆获得阳性重组质粒,然后以已知浓度的含有目的基因的质粒作为模板同时以LNA修饰的引物进行荧光定量PCR反应,作出标准曲线图以及标准曲线,通过样品检测结果与标准曲线对比,确定待测样品中的黑胫病菌的数量。该检测方法适用于烟草种植土壤中黑胫病菌定殖的检测,高效、简单易行、价格低廉,检测只需在4~5小时内即可完成,具有较高的检测灵敏度,能为我国黑胫病的防控起到一定的作用。
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