本发明公开了一种含油微藻的破壁及表面活性剂辅助提取油脂的方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：(1)将含油微藻的悬浮液调节pH值为7.5‑14，进行水热处理；(2)水热处理后，在酶存在下进行酶解反应；(3)酶解反应后加入表面活性剂进行反应，然后加入有机溶剂进行萃取并分离出油脂。本发明方法的油脂提取率高、操作条件温和、能有效保持微藻的营养组分、有机溶剂用量少、环保、能耗低，且能适用于微拟球藻、小球藻、硅藻、栅藻和单针藻等多种微藻，适用范围广。