本发明专利提供了具备焦碳酸二乙酯隔离功能的核酸酶灭活仪及其应用，其结构包括：DEPC稀释与储备罐（1）、高压灭菌锅（2）、连接阀（5）、电动机（6）、气泵（7）、DEPC加样孔（8）、进水阀（9）、储备罐进水漏斗（10）、搅拌叶（11）、枪头盒架（12）、排水阀（13）、排气阀（14）、灭菌锅顶盖（15）、加热管（16）、离心桶（17）、EP管固定仓（21）等结构组成。本发明能够一次对大量枪头和EP管进行RNase灭活，大大减轻了实验员工作量。本仪器对DEPC水封闭管理，避免实验员接触DEPC中毒事件的发生。本仪器对DEPC循环使用节约了化学试剂，并对DEPC水加热分解处理后排放，保护了环境。