用于食品中手性农药残留检测的气相色谱柱的制作方法，包括以下步骤：(1)将环糊精2,6‑位羟基上的氢取代为醚，合成出环糊精衍生物；(2)将合成出的环糊精衍生物和3‑[(2,3)‑环氧丙氧]丙基三甲氧基硅烷在乙醇溶液中反应，接着加入单体四甲氧基硅烷和催化剂盐酸溶液，反应分离后得到清液；(3)对石英毛细管内表面进行前处理，使毛细管内表面形成硅羟基；(4)把清液填充到毛细管柱中，制作成气相色谱柱。本发明所制备的气相色谱柱能够应用到各种粮食、蔬菜和瓜果等食品中手性农药残留的检测。