本发明提供了一种干制辣椒亲本的保纯防杂繁育方法，本发明建立了包括四隔离六选择步骤的繁育方法，四隔离包括空间隔离、物理隔离、单株花隔离和年限隔离；六选择包括种子、苗期、初花期、结果期、果实和抗病性选择。本发明首次提出判断亲本群体是否保持纯度的判别标准。只有亲本群体各性状变异系数都是＜5%的群体，才能认定为群体保持了一致性。用统计指标量化了对亲本纯度的入选标准，可以规避诸多性状易受环境影响而引起的变化波动。本发明还提出选择优秀单株第2‑4节位的优质花蕾来作为保纯亲本措施之一。在辣椒种子低温保存中，利用硅胶干燥剂颜色的变化，来指示干燥种子是否增加了含水量，为准确判断提供最直接的选择标准。