本发明涉及机械转轴密封领域，具体为一种氟醚化合物基磁性液体的制备方法。该制备方法包括步骤1）采用共沉淀法制备高磁饱和强度的Fe3O4纳米颗粒；2）将链长不同的氟醚类活性剂分别溶于过渡液中对磁性颗粒进行表面修饰包覆，通过加热、搅拌、超声等方式强化活性剂与颗粒之间的吸附作用；3）通过搅拌、超声将修饰好的磁性颗粒分散于载液氟醚化合物中，形成高稳定性的纳米磁性液体。本发明通过将活性剂溶于过渡液与纳米颗粒充分接触发生吸附，得到包覆效果好的颗粒，从而制备出高稳定性氟醚化合物基磁性液体。该磁性液体主要应用到机械转动轴密封领域，可密封酸碱腐蚀性、高低温、有氧介质，具有使用寿命长、密封真空度高、承压能力强等优点。