本发明公开了一种基于SoC的无线智能程序加载方法，步骤如下：搭建SoC系统；将加载启动代码烧录至只读存储器中；将flash存储器分区并加载不同的程序；初始化串行外设接口和通用异步收发传输器，从flash存储器中选择相应程序区实现程序到内存模块的拷贝；执行跳转命令，将处理器指向内存模块的起始位置，实现系统的自启动。通过带蓝牙功能的终端发送不同的命令即可选择flash程序区中不同的程序加载到内存模块，通过无线控制实现不同程序的加载，不需要添加额外的接口与复杂的模块，不需要连接下载线和IDE开发环境等工具，简化了芯片的二次开发，增加了芯片的利用率。本发明还公开了一种无线智能程序加载SoC系统。