本发明提供一种核酸分析用流动池，其是用于借助能够光化学切断的核苷酸的测序反应的核酸分析用流动池，可在提高光切断反应的反应效率的同时减少荧光检测时的干扰，从而可提高确定序列的正确性，缩短操作时间，使结合碱基长度变长。本发明的核酸分析用流动池贴合有具备滤光片(102)的第一基板(101)、具有用于形成流路的中空部中空板(103)和透过第一光的第二基板(105)，所述滤光片(102)反射使流路内物质的化学结构发生变化的第一光。