本发明公开了一种河道内定向穿越排管施工方法，其包括：S1、在河道宽度的中央进行回填土的人工筑岛，用于在河道中央排管施工；S2、在所述人工筑岛上沿河道长度方向的两边布管，将每节已焊接的管道推至河道内，形成了左、右两条定向穿越管道；S3、当两根所述定向穿越管道排管施工完成后，再在所述人工筑岛内进行反开挖，并且在所述河道内筑坝围堰截流，然后将两条定向穿越管道的顶端头切割镶接，以完成河道内排管。采用本发明，能顺利地完成2.4KM的河道内定向穿越排管施工，因此解决了本领域的技术难题。