本发明涉及一种分布式数据采集系统的运行参数管理方法及系统，该方法包括：当检测到当前CIM/E文件中有运行参数的更新数据时，采集当前CIM/E文件中的更新数据；获取其他调度中心的运行参数数据，并检测其他调度中心的运行参数数据是否有更新；根据其他调度中心的运行参数的更新数据更新预存的其他调度中心对应的运行参数数据；对采集的当前CIM/E文件中的运行参数的更新数据和预存的更新后的其他调度中心的运行参数进行整合，形成当前维护态运行参数；对当前运行参数进行校验和测试；将校验和测试合格的当前维护态运行参数同步到运行态的运行参数文件中。本发明对分布式数据采集系统的运行参数进行实时更新和管理，实现链路配置和通信索引的高效管理的目的。