本发明公开了一种有机磷杂菲衍生物及其制备方法与应用。所述有机磷杂菲衍生物的结构式如式Ⅰ所示，式Ⅰ中，式Ⅱ所示基团来自于羧酸衍生物或酰氯衍生物；基团A来自于有机磷杂菲化合物，且基团A与式Ⅱ所示基团中的R通过P‑C键连接。所述有机磷杂菲衍生物的制备方法包括如下步骤：丙三醇与羧酸衍生物或酰氯衍生物进行酯化反应得到丙三醇酯类衍生物；在催化剂的作用下，丙三醇酯类衍生物与有机磷杂菲化合物进行反应即得。本发明有机磷杂菲衍生物对聚合物的阻燃性能有提高作用，在作为功能助剂添加到制备PET、PBT等聚酯类和PA6、PA66等聚酰胺类的强极性的工程塑料中时，可提高制备所得材料的阻燃性能。