本发明涉及一种减少爆破振动对核岛底板基岩的影响的方法，其特点在于，通过预留保护层爆破增加侧向临空面，底部采用不耦合装药结构，并在孔底设置柔性垫层，采用宽孔距、小抵抗线、毫秒微差顺序起爆，该方法的步骤为：根据设计要求对核岛进行爆破开挖，并预留保护层；根据测量放线结果进行钻孔；采用小抵抗线、宽孔距设计炮孔间排距；在孔底装入柔性材料作为缓冲垫层；分三段装药，连续装药结构，底部为加强装药段；上部采用空气层装药结构，构成孔中正常装药段；孔口堵塞用常规材料填塞；起爆网络采用毫秒微差顺序起爆；爆破振动监测及振动数据分析。本发明简便易行，已在大型核电工程核岛负挖工作中得以实践，取得良好效果。