本发明涉及中药药代动力学领域，公开了一种基于体内过程的中成药质检指标辨析方法，包括：1）、样品采集；2）、样品检测；3）、数据处理；4）、数据分析：根据血药浓度‑时间的数据得到数据矩阵P，根据血浆分布和各组织分布的数据得到数据矩阵T，根据尿、粪、胆汁的累计排泄数据得到数据矩阵E，将矩阵P、矩阵T、矩阵E标准化后合并成一个矩阵，然后进行PCA分析，建立scores图，根据scores图中各化合物成分的分布，将各化合物成分分区，然后从每个分区中各筛选出代表成分，并将筛选出的代表成分作为该中成药的质检指标。本发明方法准确性高，工作量小，节约了时间，成本较低。