本发明公开一种通过乙酰氨基阿维菌素与凹凸棒结合制备微胶囊的方法，该方法包括如下步骤：（1）将乙酰氨基阿维菌素、淀粉、凹凸棒和粘合剂混合均匀，造粒；（2）将步骤（1）造粒得到的颗粒以及包衣剂装入流化床包衣机，包衣得到所述微胶囊。本发明的方法制备工艺简单，包封率高，粒径均匀，易于工业化生产，制备的微胶囊在酸、碱、氧化、强光照射、高温等条件下具有良好的稳定性，且具有较强的硬度，满足混饲要求，同时可以掩盖乙酰氨基阿维菌素的苦味，使动物采食时不会因味苦影响采食量，提高动物用药的顺应性。