本发明涉及一种防雾抗紫外聚酯薄膜的制备方法，将二元酸、水、己内酰胺按一定的摩尔比充分混合进行预聚合反应，制得HOOC‑(CONH)n‑COOH产物；再加入纳米氧化锌及苯磺酸继续搅拌进行反应，制得亲水抗紫外HOOC‑(NHCO)n‑COO‑ZnO预聚物；将制得预聚物、二元酸、二元醇、缩聚催化剂以及热稳定剂和抗氧化剂混合打浆进行酯化、缩聚反应，制备得到亲水抗紫外改性聚酯；将亲水抗紫外改性聚酯作为A组分，常规聚酯作为B组分，经过熔体管通过T型模头经共挤复合成A B双层或ABA三层，经铸片、双向拉伸、热定型及收卷制得防雾抗紫外聚酯薄膜。本发明能解决无机粉体在聚酯基体中分散性的问题。