一种混合云桌面系统，包括管理系统、云桌面应用分类管理模块、用户端、自适应插件模块、实现所述用户端与后端管理模块数据通信的通信接口模块；所述用户端包括网页客户端和移动客户端；所述管理模块包括对混合云桌面用户进行管理以及管理用户相应资源的用户资源池、管理应用的访问权限及平台安全设置的安全资源池、管理混合云桌面系统的存储资源的存储资源池、对混合云桌面提供的桌面应用进行管理的应用资源池；所述云桌面应用分类管理模块包括对混合云桌面提供的应用所基于的应用平台进行管理的应用平台管理模块、对混合云桌面提供的应用属性进行管理的应用所属管理模块、对混合云桌面提供的应用所处位置进行管理的应用位置管理模块。