本申请公开了用于台式流式细胞仪的光学引擎，该光学引擎包括激光源组；用于每个激光源的不同的光束整形光学系统组，其中每一组包括两个透镜，沿X轴水平可调地聚焦光线到同一水平位置，并且沿Y轴竖直可调地聚焦光线到沿同一平面的不同竖直位置；采集光学系统，其从流通室中采集荧光；过滤光学系统，其根据波长范围将从流通室中已采集的荧光过滤到不同检测通道中；以及用于每个检测通道的检测器，其将过滤的荧光转换成电信号，其中电信号被处理以使得来自位于不同竖直位置的每个激光源的荧光在同一检测器中被区分。