本发明提供了一种测量非线性晶体吸收系数的方法，包括以下步骤：让少许待测基频光注入光学谐振腔，选取合适透镜组，使注入光腰斑与谐振腔基模腰斑大小相等且完全重合，并记录此时的模式匹配效率；增加注入功率，调节非线性晶体温度至位相匹配，锁定谐振腔的腔长，并记录倍频光输出功率，等待几分钟后，解锁谐振腔，迅速记录模式匹配效率；依据模式匹配效率测量结果，计算谐振腔基模的腰斑大小；由腰斑大小计算热透镜焦距大小，从而反推晶体对基频光的吸收系数；改变注入光功率，重复以上步骤，测量不同注入功率下晶体的吸收系数。