本发明公开了一种制备可熔性含氟聚合物的水乳液聚合方法，使用全氟烷基乙酸盐作为链转移剂来调聚聚合反应，该全氟烷基乙酸盐的通式为CF3(CF2)nCH2COOX，n为0‑6之间的整数，X为金属或非金属阳离子，该链转移剂链转移反应过程为CF3(CF2)nCH2COO‑+R‑CF2‑CF2·→R‑CF2‑CF2H+CF3(CF2)nCH·COO‑。本发明制得的可熔性含氟聚合物，有较佳力学性能和分子量分布，并具有挥发分低和不变色的优点。