本发明公开了一种基于AFM的淀粉粒blocklets微结构数字图像表征方法。采用自然风干方法在玻片上制备淀粉样品，用原子力显微镜中的轻敲模式扫描淀粉样品，获得淀粉样品的AFM图像，并转换为图像处理软件可识别的格式，通过二值图转换、去除blocklets聚合体、去除边界的不完整结构、去除小区域干扰杂质等步骤，将剩余的目标图像区域作为blocklets微结构并进行显示，计算其长轴作为blocklets微结构的大小，从而识别并获取淀粉粒blocklets微结构的统计信息，作为数字图像表征输出。本发明具有准确、快速、客观的特点，利用数字图像处理技术对blocklets微结构进行客观表征，获得符合实际的表征结果。