本发明涉及一种柔性负荷能效电厂调度控制方法和系统，该方法包括：获取电动汽车的相关参数以及温控负荷的相关参数；根据电动汽车的相关参数、温控负荷的相关参数以及预先构建的经济成本最优的能效电厂控制目标的约束条件得到当前约束条件；能效电厂包括电动汽车集群能效电厂和温控负荷集群能效电厂；根据当前约束条件求解预先构建的经济成本最优的能效电厂控制目标得到电动汽车集群能效电厂和温控负荷集群能效电厂的输出功率；根据输出功率分别控制电动汽车集群能效电厂和温控负荷集群能效电厂的运行。该方法基于电动汽车集群和温控负荷集群对电力系统调度的影响，实现经济成本最低。