机载双星导航定位系统，包括北斗有源接收天线、无源北斗接收机箱、减振机架和射频电缆，减振机架由锁定装置、插销、弹簧减振器和机架支座组成，无源北斗接收机箱内安装隔离器、接收机、铷原子钟、分路器和电源。本发明实现了由北斗两星定位自动切换到北斗三星定位功能，使得在有三颗卫星时，不依类于铷原子钟即可以定位，提高了定位精度；本发明采用减振机架，使得铷原子钟能够工作在稳定动态环境，满足飞机上长时间工作要求；本发明采用具有储电和抗电流浪涌的电源，避免由于铷原子钟随时间漂移带来的定位误差增大，而卫星的误差只是一个随机量，不会因为工作时间长而定位精度变差。